KC-IRQuant(TCR)建库

背景介绍

TCR介导的细胞免疫应答过程中,抗原呈递细胞(APC)摄取抗原(Ag)、消化形成抗原-MHC分子复合物,并呈递给T细胞;T细胞通过自身T细胞受体β链中V-D-J基因重排后的CDR3β参与抗原识别。 TCR的基因由可变区(V)、多变区(D)、结合区(J)和恒定区(C)四部分基因片段组成,形成互补决定区(complementarities determining region, CDR)和间隔的4个骨架区(framework region, FR)。 T细胞受体基因结构如下图所示:

在T细胞发育过程中CDR1,2和FR区域相对保守,CDR3区由V、 D和J 进行重排而形成具有功能的TCR编码基因(T细胞克隆),由于V (65~100种)、D (2种)、J (13种)基因片段本身具有多样性,此外,由于在重排的过程中,在VD及D-J的连接区经常有非模板的核苷酸的随机插入或删除,进一步增加了CDR3区的多样性。这种基因片段连接的不准确性使TCR的表达呈多样性,以识别各种不同的抗原。

KC-IRQuant(TCR)建库技术

康测科技KC-IRQuant(TCR)建库技术以KC-RNA(靶向)建库技术为基础,靶向检测TCR α和β链的CDR3区域,并结合独有的UID纠错技术,全面而准确的解析TCR基因重排碱基序列,以及各序列的丰度。


KC-IRQuant(TCR)技术原理图


技术优势

  • 建库时间更短,建库效率更高
  • 对CDR3区全面检测
  • TCR基因各序列丰度的数字化准确定量