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mRNA测序
产品简介

mRNADNA转录而来,携带相应的遗传讯息,为下一步翻译成蛋白质提供所需的讯息。mRNA测序不仅可提供极为准确且高灵敏度的量化基因表达,还可识别已知的和新的转录异构体、基因融合和其他特征及等位基因特异性表达。(它可以提供编码转录组的完整视图,而并不受限于先验知识。)mRNA测序已迅速成为分析疾病状况、生物过程及广泛研究设计中的转录组的首选方法。

真核生物mRNA测序是通过mRNA 3’polyA尾富集和建库,而原核生物mRNA测序是先去除rRNA,然后建库。康测科技高质量的高通量测序文库,具有Clean Data超高比对率,保证测序数据的质量以及数据得到充分利用。

 

技术流程

建库方法                                                                                       项目流程                 

 

技术优势
  1. 微量建库低至200 ngRNA起始量
  2. 绝对定量转录组测序、单细胞转录组测序、RNA靶向测序等丰富的产品类型,满足多种测序需求
  3. 可对GSEA、可变剪接、RNA编辑、可变PolyA位点等进行个性化分析

 

结果展示

差异表达基因数目统计                                            差异表达基因MA plot

差异可变剪接事件统计                                 差异可变剪接事件GO富集分析

 

案例解析

H3K36me3调控mRNA可变剪接影响植物对温度的敏感性

组蛋白修饰调控表达量发生变化,是常见的基因表达调控机制之一。此外组蛋白修饰还能调控mRNA的可变剪接,丰富蛋白质种类,最终引起表型发生变化。文章作者以模式生物拟南芥为研究对象,利用mRNA-seqChIP-seq及两者关联分析,发现组蛋白H3K36me3甲基化修饰调控温度改变引起的可变剪接变化并影响植物花期对周围环境温度的响应。

拟南芥在16℃环境中种植,每天光照8小时,种植5周;然后将温度调至25℃,同样光照条件,在25℃种植1天、3天、5天后,分别取样进行mRNA测序,并分析可变剪接,筛选由温度变化引起的差异可变剪接,发现部分差异剪接基因与植物开花、生物钟相关。

参考文献

Pajoro A, Severing E, Angenent G C, et al. Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants[J]. Genome Biology, 2017, 18(1):102.

 

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技术支持:拿到转录组测序报告,你该关注什么?