miRNA测序-武汉康测科技有限公司

表观遗传学研究

ChIP-seq (染色质免疫共沉淀测序） CUT&Tag ATAC-seq (染色质可及性测序） BS-seq (DNA甲基化测序） m6A-seq (m6A meRIP） m5C-seq (m5C meRIP) bsRNA-seq (m5C RNA甲基化测序） ac4C-seq (ac4C acRIP) G4-ChIP-seq·G-四链体染色质免疫共沉淀测序 m7G meRIP-seq（m7G RNA甲基化测序）
转录组学研究

绝对定量转录组测序（UMI RNA-seq） mRNA测序 miRNA测序 lncRNA测序 circRNA测序互作转录组测序 CAGE-seq
互作&免疫

转录因子ChIP测序 DAP-seq（DNA亲和纯化测序） B细胞受体（BCR）测序 T细胞受体（TCR）测序 RIP测序 CLIP测序 eCLIP-seq
基因组学研究

全基因组重测序宏基因组测序外显子组测序

miRNA测序

研究对象

miRNA-seq仅能检测miRNA吗？

不是的，miRNA-seq还可以检测部分piRNA、siRNA等小RNA的表达

miRNA是一类长度为10-30 nt的调控RNA，它可以通过降解mRNA、调控翻译的起始、延伸等过程，调控基因的表达。miRNA绝大部分是pol II转录的pri-miRNA经过一系列加工过程成熟的，其加工过程主要有：

Drosha/DGCR8复合物将pri-miRNA切割成70 nt左右的茎环结构，生成pre-miRNA；
Exportin5将pre-miRNA转运到细胞质中；
Dicer进一步切割生成22 bp左右的双链miRNA；
Ago2 RISC复合体将降解其中一条链，生成成熟的RISC复合体；
miRNA引导RISC复合体到mRNA上，行使其翻译调控、RNA降解等调控功能；

miRNA-seq

miRNA-seq是为检测miRNA的表达情况发展出来的高通量测序方法。miRNA加工过程中的Drosha、Dicer都是RNase III家族核酸酶，因此miRNA的5’为-PO4基团，3‘为-OH基团，可以直接用于连接反应。另外其长度为特征性的18-30 nt，因此通过直接对Total RNA进行连接反应，并回收插入长度在18-30nt的片段，就可以富集miRNA、建库测序，并分析miRNA的表达情况。