科技服务
scientific research
miRNA测序
产品简介

Small RNA是指长度在21-31nt的内源性非蛋白质编码RNA,广泛存在于高等和低等生物体内。Small RNA与细胞的发育、分化、疾病等密切相关。近年来的研究表明,Small RNA 不仅可作为癌症诊断、识别、预后的标志物,也在癌症治疗中发挥作用。

Small RNA包括:miRNAncRNAsiRNAsnoRNApiRNArasiRNA等,分别在表观遗传水平、转录及转录后水平调控基因表达;通过mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除等多种途径,广的泛参与调控生物体的生长发育和疾病发生。Small RNA测序能鉴定和定量解析已知small RNA,并预测新的small RNA及预测small RNA的靶基因,是研究small RNA的功能和调控机制的有力工具。 

 

技术流程

建库方法                                                                            项目流程                                 

 

技术优势
  1. 超低起始量建库技术
  2. 准确预测miRNA靶基因:使用多种生物信息学软件对miRNA靶基因预测,通过交集最终确定靶基因
  3. 对差异miRNA靶基因GOKEGG富集,深度解析miRNA的功能

 

结果展示

Small RNA长度分布统计                                  miRNA各位点碱基偏好         

 

差异表达火山图                                                 miRNA靶基因网络关系 

 

案例解析

miRNA测序发现怀孕相关microRNA,可为孕期疾病诊断提供依据

作者对健康未孕人群、孕妇的血清和血浆样本及胎儿脐带血、胎盘组织样本进行microRNA测序,分析microRNA图谱,寻找母体和胎儿血液中循环microRNA和胎盘microRNA之间的联系。根据microRNA图谱可区分怀孕和未孕人群,并为孕期疾病(如子痫前期)的诊断提供依据。分析胎盘特异表达的microRNA变体还可追溯胎盘组织的来源。在孕妇血液和胎儿脐带血、胎盘组织中,与怀孕相关的mir-498mir-127mir-134的含量显著高于未怀孕妇女和孩子父亲血液中的含量。其中mir-498在胎盘中的含量远远高于孕妇血液和胎儿脐带血中的含量,是一种胎盘特异性的microRNA,由胎盘释放进入母体和胎儿。

通过对胎盘组织、胎儿脐带血、母亲血清、父亲血清、未怀孕对照血清中的microRNA表达谱进行聚类分析发现,胎盘和胎儿脐带血的microRNA表达谱最为接近,其次是胎盘和母亲血液,而父亲和对照组的聚类关系最远。

http://seqhealth.cn/image/small_RNA_sequencing/small-seq-4.png  

参考文献

Williams Z, Bendov I Z, Elias R, et al. Comprehensive profiling of circulating microRNA via small RNA sequencing of cDNA libraries reveals biomarker potential and limitations.[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2013, 110(11):4255-60.