互作转录组可以帮助我们研究物种之间的寄生、感染、共生等互作用关系,只构建一个文库就可以对多个互作的物种进行表达量的研究。不过互作转录组说起来简单,做起来可不容易。 困难1:RNA量相对较低 ...
卵巢癌中关键的RBP——SORBS2 作者基于GEO数据库和cBioPortal数据库对卵巢癌相关的已知RBP基因进行筛选, 发现SORBS2显著影响卵巢癌细胞的转移克隆形成能力,SORBS2的低表达与卵巢癌患者不...
三四十页的转录组的测序报告不知该如何入手,众多分析结果不知该关注哪些?我们就从RPKM到KEGG,慢慢讲解。 1.什么是RPKM值? 2.如何看懂火山图? 3. MA plot和火山图有什么区别? ...
互作转录组(Dual RNA-seq)则不需要分离物种,直接采样并提取样本中所有的RNA,构建一个转录组文库,便能同时对2个(或多个)物种进行测序和分析,同时研究两个或多个相互作用的物种的转录表达情况。这年头,靠转录组发...