Small RNA测序(Small RNA sequencing)

简介

Small RNA是指长度在21-31nt的内源性非蛋白质编码RNA,广泛存在于高等和低等生物体内。Small RNA与细胞的发育、分化、疾病等密切相关,是重要的调控元件。近年来的研究表明,Small RNA 可用于癌症的诊断、识别、治疗、预测 治疗因子等。

Small RNA包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。

Small RNA通过多种多样的作用途径,包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生。Small RNA转录组测序是鉴定和定量解析small RNA的新方法和有力工具。


建库方法


技术流程


分析结果展示


康测技术优势

  • 超低起始量建库技术
  • 多种生物信息学软件对miRNA靶基因预测,交集确定miRNA靶基因提高准确性
  • 对差异miRNA靶基因GO、KEGG富集,深度解析miRNA的功能

案例解析

在这项研究中,作者对健康未孕人群、孕妇的血清和血浆样本及胎儿脐带血、胎盘组织样本进行microRNA测序,分析microRNA图谱,寻找母体和胎儿血液中循环microRNA和胎盘microRNA之间的联系。根据microRNA图谱可区分怀孕和未孕人群,并为孕期疾病(如子痫前期)的诊断提供依据。分析胎盘特异表达的microRNA变体还可追溯胎盘组织的来源。 在孕妇血液和胎儿脐带血、胎盘组织中,mir-498、mir-127、mir-134的含量显著高于未怀孕妇女和孩子父亲血液中的含量,这三种microRNA与怀孕相关,其中mir-498在胎盘中的含量远远高于孕妇血液和胎儿脐带血中的含量,它是一种胎盘特异性的microRNA,由胎盘释放进入母体和胎儿。

通过胎盘组织、胎儿脐带血、母亲血清、父亲血清、未怀孕对照血清中的microRNA表达谱进行聚类分析发现,胎盘和胎儿脐带血的microRNA表达谱最为接近,其次是胎盘和母亲血液,而父亲和对照组的聚类关系最远。

参考文献:
Williams Z, Bendov I Z, Elias R, et al. Comprehensive profiling of circulating microRNA via small RNA sequencing of cDNA libraries reveals biomarker potential and limitations.[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2013, 110(11):4255-60.