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研究发现肝癌肿瘤组织中TCR多样性降低
2019-04-04

实验设计:肝细胞癌(HCC)患者,Ⅰ期3人(其中一人HBV阳性被剔除),II期1人,IVB 期2人。肿瘤切除前未接受过放化疗。分别取外周血(P)、癌旁正常组织(N)、肿瘤组织(T),分离T细胞、进行高通量测序。

TCR是T细胞识别不同抗原的关键受体,具有高度多样性。作者通过 TCR-seq 获取T细胞受体(TCR)的α链和β链全长序列信息,分析T细胞克隆丰度。

 

TCR可用于T细胞克隆群的确定,因为具有完全相同的TCR(α链和β链配对)的多个T细胞只可能来自于同一T细胞的扩增克隆。作者将具有完全相同的α链和β链配对的T细胞定义为来自同一祖先的细胞,当3个以上细胞具有相同α-β链配对模式,则将其定义为扩增克隆。

 

大部分T细胞具有唯一的α-β链配对,在正常组织和外周血中发现的扩增克隆TCR只占总CD 8+ T细胞的10%,而在肿瘤组织中,该比例高达约30%。与外周血或癌旁正常组织相比,肿瘤组织CD8 +T细胞的扩增克隆TCR比例要高得多,且与HCC进程相关。在调节T细胞中也发现了类似的扩增克隆TCR增多现象,这可能是由于肿瘤病灶处的T细胞被激活并增殖导致。

肿瘤微环境内的T细胞易于发生耗竭,或调节T细胞发生抑制,在HCC肿瘤微环境中的肿瘤浸润细胞,效应 CD8+T细胞更少,而耗竭细胞更多。且越是晚期的患者,T 细胞的耗竭趋势越明显。

其中,n表示某一TCR(α-β配对)出现的次数:n=1说明该TCR出现1次,来自唯一的T细胞(unique);n=2说明该TCR出现2次,来自复制的T细胞(duplicated);n≥3说明该TCR出现多次,来自T细胞的扩增克隆群(clonal)。T细胞扩增克隆群的增加反映了TCR多样性降低。

 

参考文献:Zheng C, Zheng L, Yoo J, et al. Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing[J]. Cell, 2017, 169(7): 1342-1356.