m7G修饰

 

m7G修饰最为熟知的形式是存在于真核生物mRNA5’帽子结 构中,后续研究表明tRNArRNA上也存在丰度较高的m7G修饰,此外miRNA也存在m7G修饰。真核生物mRNA帽子结构m7G修饰已经研究众多,而对于mRNA内部修饰(5’UTR/CDS/3’UTR区域)研究相对较少,存在巨大研究  价值。

m6A修饰类似,对m7G进行研究同样绕不开催化/擦除m7G修饰的甲基化酶(Writers/甲基化酶(Erasers),以及各种阅读器蛋白(Readers),目前鉴定到的WritersMETTL1Eraser还未知;Readers为最新鉴定到的QKI7

 

 

 

m7G meRIP-seq原理

 

 

结果展示

Peak在RNA功能元件分布
Gene track
实测motif
文献报道motif

 

 

文章案例

 

QKI将具有内部m7G修饰的转录本穿梭成应激颗粒并调节mRNA的代谢

 

 

 

  1. m7G meRIP-seq联合QKI7 RIP-seq证明QIK7结合mRNA内部m7G修饰。说明其潜在reader特性;
  2. Co-IP证明QKI7可以在应激状态与应激颗粒蛋白G3BP1互作,通过荧光成像证明QKI7在应激条件下可以将具有内部m7G修饰的mRNA穿梭成应力颗粒;
  3. 敲低QIK7可以显著降低全局mRNA的半衰期,而过表达WTQKI7可以挽救该表型;这些半衰期降低的mRNAQKI7结合的mRNA重叠较好,说明QKI7可以在应激条件下增强这些mRNA的稳定性;
  4. RNA-seq联合Ribo-seq确定QKI7可以使其结合靶标翻译效率降低。

 

m7G meRIP-seq