生信小课堂•用云平台绘制组合散点图

 
01 工具简介
 
 
组合散点图(Composite Scatter Plot)是散点图的一种扩展应用,通常在同一个坐标系中展示多个数据集或多个变量之间的关系。通过组合散点图,可以清楚直观地分析不同数据集之间的联系、分布趋势和相互影响
 
图1 文献中的组合散点图
 
02 康测科技组合散点图云工具
 
1. 页面模块化,功能划分简洁
 
从左往右依次为导航栏、使用指南、数据预览、参数设置和问题解答。
 
图2 工具初始界面
 
2. 零代码操作,参数自由设置
 
(1)自由选择分组
 
输入文件第一列为基因名字,第2、3列为X轴和Y轴对应数值,若输入数据中存在分组信息并需要进行展示,则可以将输入文件的第四列作为分组信息。输入文件应为制表符(Tab键)分隔,Excel 的 xlsx 或 xls 文件可以使用本平台“表格格式转换”工具进行转换。
 
图3 示例输入文件样式
 
(2)自由设置标题
 
可以在参数设置中指定X轴与Y轴的内容,根据需求自定义输入。
图4 自由设置X,Y轴标题
 
(3)自由设置类型
 
云工具支持设置组合图类型,包括density,histogram,boxplot三种样式,可根据需要自由选择。
 
图5 自由设置组合图类型
 
03 康测科技云分析平台试用
 
康测科技云分析平台整合超过100种组学分析工具,配备详细、精炼的讲解视频和工具文档,全程零代码、自主参数设置。如果您有使用需求,可私信小编,小编将给您发送试用账号~
 
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04 参考文献
 
1. Suguru Nishijima, Naoyoshi Nagata, Yuya Kiguchi, et al. Extensive gut virome variation and its associations with host and environmental factors in a population-level cohort[J]. Nature Communications, 2022
 
2. Matthew S Welhaf, Hannah Wilks, Andrew J Aschenbrenner, et al. Naturalistic assessment of reaction time variability in older adults at risk for Alzheimer’s disease[J]. Journal of the International Neuropsychological Society, 2024
 
3. Gael Grenouillet, Laetitia Buisson, Nicolas Casajus and Sovan Lek. Ensemble modelling of species distribution: the effects of geographical and environmental ranges[J]. Ecography, 2011
 

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关于康测

 

康测致力于先进组学技术的开发和在生物医学研究领域的应用,建立了涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、表观转录组学、免疫组学和互作组学的全面组学服务体系。而在医学检测方面,康测基于自主研发的SMP(Stranded Multiplex PCR)靶向测序技术,可提供检测灵敏度和特异性均为100%的MRD一站式自动化解决方案。
康测提供全面的基因表达调控研究工具
康测提供高度自动化MRD一站式解决方案

 

创建时间:2025-01-07