Chip-seq：DNA结合蛋白功能的研究工具

        人类基因组的20000个蛋白编码基因中，约有2000个具备DNA结合的能力。这些DNA结合蛋白包括染色体组装的组蛋白、DNA复制相关结构蛋白、核酸酶和DNA聚合酶，转录相关转录因子和RNA聚合酶等。其中转录因子的数量最多，约有1500个。

        转录因子蛋白通常具有DNA结合结构域和功能结构域。根据DNA结合结构域的特征，转录因子可以被划分成数十个家族。通过识别增强子或启动子的相应序列结合到DNA上之后，转录因子可以通过多种方式行使对转录的调控功能：

1. 部分转录因子结合到转录起始位点附近的DNA启动子序列，并帮助形成转录起始复合物；
2. 部分转录因子结合调节序列，例如增强子序列，刺激或抑制相关基因的转录；
3. 部分转录因子（先驱转录因子），则可以招募修饰酶，调控基因的组蛋白修饰和DNA甲基化状态，改变染色质构象从而调控基因的转录；

        Chip-seq就是研究这些DNA结合蛋白功能的重要工具。Chip-seq测序（CHromatin ImmunoPrecipitation and high-throughput SEQuencing）是将染色质免疫共沉淀和高通量测序相结合的技术。通过特异性抗体，将待研究的目标DNA结合蛋白-DNA形成的复合物沉淀下来，从而获取该蛋白结合的DNA。通过对DNA进行高通量测序，即可获得该蛋白在染色体上结合的情况。

        Chip-seq的流程包括细胞/组织交联、细胞核提取、染色质片段化、免疫共沉淀、DNA回收、文库构建、高通量测序和生信分析等一系列步骤，如下图所示：

您只需要：

1、提供目标蛋白和样品信息，评估可行性；

2、提供样品和抗体，剩下的我们来做；

3、收到实验和分析报告，使用数据；

我们是专业的Chip-seq技术服务供应商：

• 严格的质控体系：我们的服务提供三重质检，保证结果的可靠性；

• 领先的技术：我们有近千次IP锤炼出来的IP体系；

• 全物种覆盖：我们有最先进的细胞核分离纯化技术，再罕见的物种、再复杂的组织类型，都不是问题；

• 自动化IP工作站：我们建设了国内唯一的自动化IP工作站，可以在1天时间内完成32个样品的平行IP实验，缩短项目周期、提高结果稳定性；

•  项目经验丰富：我们累计提供了几十种组蛋白、转录因子，50多个物种的上千次Chip-seq服务；

一个好的Chip-seq实验，需要具备以下素质：

1）良好的免疫共沉淀效果：足够的特异性和足够的IP效率；

2）分析结果应该符合目的蛋白已知的结合模式。

转录因子

Chromatin Remodelling Protein

Chromatin Remodelling Protein