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miRNA-seq仅能检测miRNA吗?
不是的,miRNA-seq还可以检测部分piRNA、siRNA等小RNA的表达
miRNA是一类长度为10-30 nt的调控RNA,它可以通过降解mRNA、调控翻译的起始、延伸等过程,调控基因的表达。miRNA绝大部分是pol II转录的pri-miRNA经过一系列加工过程成熟的,其加工过程主要有:
- Drosha/DGCR8复合物将pri-miRNA切割成70 nt左右的茎环结构,生成pre-miRNA;
- Exportin5将pre-miRNA转运到细胞质中;
- Dicer进一步切割生成22 bp左右的双链miRNA;
- Ago2 RISC复合体将降解其中一条链,生成成熟的RISC复合体;
- miRNA引导RISC复合体到mRNA上,行使其翻译调控、RNA降解等调控功能;
miRNA-seq
miRNA-seq是为检测miRNA的表达情况发展出来的高通量测序方法。miRNA加工过程中的Drosha、Dicer都是RNase III家族核酸酶,因此miRNA的5’为-PO4基团,3‘为-OH基团,可以直接用于连接反应。另外其长度为特征性的18-30 nt,因此通过直接对Total RNA进行连接反应,并回收插入长度在18-30nt的片段,就可以富集miRNA、建库测序,并分析miRNA的表达情况。
技术应用
- 单独使用:生物学变化过程中miRNA的表达情况研究;
- 单独使用:血清、血浆、外泌体等miRNA生物标志物研究;
- 和mRNA-seq联合使用:构建生物学变化过程的miRNA-mRNA调控网络;
- 和circRNA-seq联合使用:构建miRNA-circRNA调控网络;
- 多组学联用:构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络
服务流程
您只需要提供细胞、组织、血清或RNA,我们将为您提供全流程服务!
产品优势
- 采用Qiagen建库试剂盒,成本虽高,但灵敏度最高、偏好性最低!
- 采用UMI数字标签纠错,去除PCR、测序等引入的假阳性重复!
- 强大的生信分析团队,提供全面的分析结果!
结果示例
UID miRNA-seq
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