康测科技Ribo-seq技术优化，突破物种限制！

Ribo-seq简介

引言

Ribo-seq（Ribosome profiling sequencing，核糖体印记测序）是翻译组学常用研究技术，通过对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序，来准确获取样本中所有可翻译分子（包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA、circRNA等）的信息与精确定量，是连接转录组与蛋白质组的桥梁。

Ribo-seq原理

由于核糖体对与之结合的~30nt RNA片段具有保护作用，当利用RNA酶消化细胞中的RNA后，这些被核糖体保护、正在翻译的RNA片段可以被富集，再经过一系列提取、分离、纯化、建库、深度测序和分析，就能获得全面的、高质量的蛋白质翻译效率信息。此外，结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析，可以更全面、精确地研究转录后调控 、翻译调控机制。

康测科技Ribo-seq技术优化

康测科技Ribo-seq技术优化后，拓宽了物种适应性：人、小鼠、斑马鱼、玉米、拟南芥等研究对象均可适用。同时可选择采用UMI数字标签，去重纠错，定量更准。

送样要求

物种：人、小鼠、斑马鱼、玉米、拟南芥，其余物种请咨询对应地区销售经理送样量：1、细胞≥1×10^72、动物组织≥300 mg3、植物组织≥1 g

Ribo-seq项目流程

应用场景

一、翻译机制的探索

1. 关注正在翻译的基因中，哪些处于高效翻译，调控参与翻译效率的元件有哪些；

2. 解释双解码的发生机制，哪些基因可以发生双解码，具有哪些结构特征。

二、深化转录组分析

1. 关注差异表达的基因中，究竟有哪些正在翻译，且翻译效率如何；

2. 缩小差异基因的范围，只关注正在翻译的基因。

三、可用于解释转录组和蛋白组结果不一致

1. 当基因转录不翻译，或者翻译效率低时，可能会出现转录组显示有差异或者差异显著，而蛋白组无差异或差异不显著

2. 若只检测了蛋白组，仅能粗略定位到基因区域，但无法明确转录本，更无法明确转录本中的编码ORF。

四、深化非编码RNA的测序分析

1. 当用于探究lncRNA和未知编码潜能的转录本是否具有编码功能；

2. 研究circRNA对应的线性RNA是否具有翻译功能，开环后是否在进行翻译。