生信小课堂•用云平台绘制小提琴图

生信小课堂•用云平台绘制小提琴图

工具简介

小提琴图 (Violin Plot)，用于展示多组数据的分布状态以及概率密度，兼具箱形图和密度图的特征，不仅可以展示统计信息，还可以呈现数据的整体分布情况，适用于样本量较大、数据分布复杂的场景。其主体部分形似一组垂直排列的“小提琴”，一个“小提琴”代表一列数据或类别。

图一 小提琴图要素

图2 文献中的小提琴图

康测科技小提琴图云工具

1.页面模块化，功能划分简洁

从左往右依次为导航栏、使用指南、数据预览、参数设置和问题解答。

图3 工具初始界面

2.零代码操作，参数自由设置

1)自由设置箱线宽度

在参数设置选项中，可一键调节箱型的宽度，按照需求，随意调整。

图4 不同宽度参数的小提琴图

2)多种配色方案自由选择

小提琴图云工具提供多种配色方案，根据需求自由选择，操作简单一键换色。

图5 多种配色方案

图6 不同配色方案（左default，右futurama）

3) 支持添加/去除图中标题

可在右侧参数设置模块内输入各项标题，自由设置，可根据需要添加或去除图中标题。

图7 标题参数设置

图8 可选择添加各个标题

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参考文献

1.Zhang, L., Zhang, M., Huang, S. et al. A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabits the xylem sap in maize plants[J]. Nat Commun, 2022

2.Shiyuan Wang, Qi Zhang, Chunlu Yu, et al. Immune cell infiltration-based signature for prognosis and immunogenomic analysis in breast cancer[J]. Briefings in Bioinformatics, 2021

3.Haensel D, Jin S, Sun P, et al. Defining Epidermal Basal Cell States during Skin Homeostasis and Wound Healing Using Single-Cell Transcriptomics[J]. Cell Rep, 2020